partitionfinder是用来在建立进化树时筛选最优进化模型以及分区（分隔）方案的软件。PartitionFinder所得的分隔模型比之前的简单处理更加合理，不仅如此，PartitionFinder在获得最优化分隔方案后，同时会给出每个分隔模块所对应的最优进化模型。下面我们就来介绍一下使用方法：
操作步骤首先，准备好phylip格式的序列文件再准备cfg文件首先是序列文件的名字然后是所有的分区是否使用一样的枝长，linked就是一样的枝长然后设置所有需要检验的模型然后选择使用哪种分值，一般都是aicc然后写好基因的分区文件然后设置搜索策略，一般都是贪婪搜索。在Anaconda中运行程序D:LearnAnaconda2_64python.exe PartitionFinder.py beetles在文件夹中生成了很多结果文件，最主要的就是best_scheme.txt，并且会生成各种系统发育软件所需要的分区文件好了，以上就是使用partitionfinder选择系统进化模型的全部操作。原创不易，如果文章对你有所帮助，记得点赞收藏加关注噢！关注我们Get更多科研小工具~
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